Nach den Ereignissen in dem Themenpark Jurassic World auf der Insel Isla Nublar können die Dinosaurier seit vier Jahren frei leben, bis ein Vulkanausbruch ihre Existenz bedroht. Die frühere Parkmanagerin Claire Dearing hat nun die Dinosaur Protection Group (DPG) gegründet - eine Organisation zum Schutz der Dinosaurier. Sie engagiert Owen Grady, einen ehemaligen Dinosaurier-Trainer, welcher beim Park gearbeitet hatte, um ihr zu helfen, die restlich verbliebenen Dinosaurier von der Insel zu retten. Owen will außerdem Blue ausfindig machen, die letzte Überlebende der vier Raptoren, die er einst trainiert und großgezogen hatte. Außerdem bricht ein neu geschaffener Gen-Hybrid namens Indoraptor aus.

Als Prinzessin Aramanda aus einem 100-jährigen Tiefschlaf erwacht, muss sie feststellen, dass die Welt, wie sie sie kannte, nicht mehr existiert. Stattdessen hat mittlerweile ihre böse Stiefmutter Tambria, der sie ihren magischen Tiefschlaf überhaupt erst zu verdanken hatte, das Königreich mit Dunkelheit überzogen und die Herrschaft übernommen. Aramanda fasst daher den kühnen Entschluss, Königin Tambria und ihren finsteren Dienern den Kampf anzusagen. Mit der Unterstützung einer guten Fee schart sie dafür mehrere tapfere Mitstreiter um sich. Nur gemeinsam können sie die schrecklichen Prüfungen, die undurchdringlichen Wälder und die furchteinflößenden Kreaturen bezwingen, die sich ihnen in den Weg stellen