In der nicht mehr allzu fernen Horrorzukunft haben die Menschen die verwüstete Erde den Monstern überlassen und sind auf einen Stützpunkt im Weltall gezogen. Dort findet alsbald ein Aufstand statt gegen die als korrupt empfundene Regierung, wobei Rags Vater den Tod findet. Der Sohn wird mit anderen Jugendlichen auf die Erde verbannt, wo er in zerstörten Landschaften gegen Monster kämpfen. Allerdings erfährt er auch von der Prophezeiung, dass einer mit dreizehn Narben die Rebellion dereinst zum Sieg führen wird. Rags trägt dreizehn Narben.

Vierter Pokémon-Film aus dem Jahr 2002. Ash, Pikachu und ihre Freunde begegnen im Wald dem Pokémon Celebi, der die Fähigkeit besitz, zwischen den Zeiten zu reisen. Für die Freunde beginnt damit eines der größten Abenteuer ihres Lebens - und eines der gefährlichsten.