Ein unbekanntes Flugobjekt wird vor der Küste Seattles abgeschossen. Als ein Team losgeschickt wird um das mysteriöse Objekt zu bergen, taucht auf einmal eine schwarze Wolke auf, die sich schnell zu einem Unwetter entwickelt. Major Emma Peterson (Ona Grauer) wird damit beauftragt die Stadt Seattle zu beschützen. Damit ihre Kinder sicher sind, schickt ihr Verlobter Tom Reynolds (Esai Morales) die beiden Kinder nach Hause. Er ahnt jedoch nicht, dass sie sich damit geradewegs in die Gefahrenzone des nun aufbrausenden Unwetters begeben. Der Supersturm muss dringend gestoppt werden, bevor er nicht nur Seattle, sondern den ganzen Planeten zerstört.

Jane Browing hat in der Armee schnell Karriere gemacht und ist ganz zufrieden mit ihrem Job. Doch dann gerät bei einem scheinbaren Routineeinsatz alles aus den Fugen. Mit ihrem Team soll sie ein Drogenlabor untersuchen. Aber das Labor entpuppt sich als tödliche Falle. Es ist mit einem geheimen Biokampfstoff kontaminiert, der Janes gesamtes Team auslöscht. Nur sie bleibt auf wundersame Weise verschont. Bei der folgenden Untersuchung stellt der Armee-Arzt Dr. Graham Knight zudem fest, dass Jane über ein geschärftes Wahrnehmungsvermögen und unvorstellbare Selbstheilungskräfte verfügt. Jane ahnt, dass sie fortan in großer Gefahr schwebt - und haut aus dem Labor ab. Schon bald ist nicht nur die Armee hinter ihr her...