Die Ausreißerin Rogue, die aufgrund ihrer wachsenden Mutantenkräfte, nämlich die Fähigkeit, durch Berührung die Persönlichkeiten, Erinnerungen und Kräfte anderer Menschen kurzzeitig zu absorbieren, von zu Hause weggelaufen ist, trifft bei ihrer Flucht in Kanada auf den Einzelgänger Logan, der geschärfte Sinne und die Fähigkeit besitzt, eigene Verletzungen in Sekunden zu heilen. Dazu ist sein Skelett vollständig mit einem schier unzerstörbarem Metall (Adamantium) überzogen und mit sechs ausfahrbaren Klauen bewaffnet; Logan kann sich aber nicht erinnern, wann und wo sein Skelett derart behandelt worden ist, noch hat er irgendeine Erinnerung an seine eigene Vergangenheit.

Der US Army-Offizier Nick Preston brüskiert die Präsidentin. Als Strafe wird er auf eine Deponie für ausgedientes Militärmaterial versetzt. Kaum hat er seinen Dienst angetreten, da trennt ein heftiges Erdbeben Kalifornien vom Festland ab. Kalifornien und der Kontinent sind unerreichbar durch ein hochtoxisches Meer getrennt. Nachdem Preston und McBride die Rangfolge geklärt haben, beginnen sie zusammen mit Simco den Stützpunkt wieder aufzubauen. Aber nicht nur sie haben überlebt, sondern auch eine Horde brutaler Häftlinge eines Hochsicherheitsgefängnisses. Die Häftlinge unter Führung des charismatischen Jesus wollen das Wasser des Stützpunktes und halten neben einer jungen Frau und ihrer Schar Kinder auch Simcos Frau und einen Piloten gefangen, der einen Weg zurück zum Festland kennen könnte. Preston und die anderen stellen sich dem Kampf und es gelingt ihnen alle zu befreien.

Als Frau und Sohn des Feuerwehrmanns Gordon Brewer vor seinen Augen bei einem Bombenanschlag auf die kolumbianische Botschaft ums Leben kommen, kennt der Mann nur noch ein Ziel: Rache! Doch Polizei und FBI halten sich bei ihren Ermittlungen aus diplomatischen Gründen zurück. So macht sich Gordon allein nach Südamerika auf, um dem Attentäter Perrini, der sich selbst "Der Wolf" nennt, den Garaus zu machen. Doch die Verstrickungen von Militär, CIA und Terrororganisationen scheinen schier undurchdringbar.