Die Computerfreaks Milo Hoffmann und Teddy Chin gründen mit zwei weiteren Freunden im Silicon Valley ein Startup-Unternehmen und entwickeln in einer Garage Open-Source-Software. Sie sind überzeugte Programmierer für freie Software. Während sie sich ein Live-Interview mit Gary Winston ansehen, dessen Konzern N.U.R.V. (Wahlspruch: Never Underestimate Radical Vision) der mächtigste und einflussreichste Hersteller von proprietärer Software ist, bekommt Milo einen Anruf, in dem Gary ihm und Teddy einen Job in seinem Unternehmen anbietet. Teddy lehnt sofort ab, aber Milo steigt nach einem beeindruckenden Besuch von Garys Villa bei N.U.R.V. ein. Er bekommt den Auftrag, das Herzstück eines innovativen globalen Kommunikationssystems namens Synapse zu programmieren, das in der Lage sein wird, satellitengestützt sämtliche Kommunikationsgeräte multimedial miteinander zu vernetzen...

Ein Jahr nach den Ereignissen des ersten Teils ist der "Nephilim" (halb Mensch und halb Engel) Aaron noch immer auf Reisen durchs Land, wobei er gefallene Engel erlöst, die seinen Weg kreuzen. Als Aaron eine nahegelegene Universität besucht, stößt er auf einen obsessiven Professor. Durch die Diskussion mit ihm stellt Aaron nun seine Aufgabe in Frage. Denn auch wenn jemandem etwas prophezeit wurde, die endgültige Entscheidung, ob man diesem Weg folgt, muss jeder selbst fällen. Aaron weigert sich nun vorerst, weitere gefallene Engel in den Himmel zurückzuschicken, bis er mehr Antworten erhält. Der Professor hält einen anderen Nephilim in seinem Haus gefangen. Dieser Nephilim stellt sich als Vilma Rodriguez, Aarons alte High-School-Liebe heraus. Aaron rettet Vilma, doch im Zuge dessen werden die bösen Mächte erneut auf ihn aufmerksam. Um ihn zu retten, muss Camael sein Leben riskieren und wird gefangen genommen.

Die Zylonen wurden vom Menschen erschaffen. Sie rebellierten. Es gibt viele Kopien. Und sie haben einen Plan. Ursprünglich war es die Bestimmung der Zylonen, der Menschheit als willenlose Roboter zu dienen. Doch dann rebellierten sie und entwickelten sich weiter. Mittlerweile sehen sie genauso aus wie ihre Schöpfer. Ihr Plan ist einfach und radikal - die Gattung Mensch auszurotten, von der sie einst versklavt wurden. Der verheerende Großangriff der Maschinenwesen hat nur einen Fehler: Es gibt Überlebende, denen die Flucht in die Tiefen des Weltraums gelingt. Um ihren Plan doch noch zu verwirklichen, müssen die Zylonen improvisieren. Zwei ihrer mächtigsten Anführer gehen getrennte Wege, um die letzten Menschen aufzuspüren und gnadenlos auszulöschen.

Als in Los Angeles von einem Moment auf den nächsten der Strum ausfällt, bricht das Chaos aus. Michts funktioniert mehr, und die öffentliche Ordnung ist nahezu direkt nicht mehr vorhanden. Für Annie, die zusammen mit ihrem MAnn Matthew ín einer schicken Vorstadtsiedlung lebt, ist dies allerdings ein riesiges Problem, denn ihr Baby ist krank und braucht dringend Medikamente. Matthew traut sich allerdings nicht, in die gesetzlose Innenstadt zu gehen, also ist es an Annie, jetzt die Initiative zu ergreifen.

Die Computerfreaks Milo Hoffmann und Teddy Chin gründen mit zwei weiteren Freunden im Silicon Valley ein Startup-Unternehmen und entwickeln in einer Garage Open-Source-Software. Sie sind überzeugte Programmierer für freie Software. Während sie sich ein Live-Interview mit Gary Winston ansehen, dessen Konzern N.U.R.V. (Wahlspruch: Never Underestimate Radical Vision) der mächtigste und einflussreichste Hersteller von proprietärer Software ist, bekommt Milo einen Anruf, in dem Gary ihm und Teddy einen Job in seinem Unternehmen anbietet. Teddy lehnt sofort ab, aber Milo steigt nach einem beeindruckenden Besuch von Garys Villa bei N.U.R.V. ein. Er bekommt den Auftrag, das Herzstück eines innovativen globalen Kommunikationssystems namens Synapse zu programmieren, das in der Lage sein wird, satellitengestützt sämtliche Kommunikationsgeräte multimedial miteinander zu vernetzen...

Der Waise Aaron hat erfahren, dass er ein Nephilim ist, sprich eine Mischung aus Mensch und Engel. Der 18-Jährige ist Teil eines göttlichen Plans und soll mit Hilfe seiner übernatürlichen Talente alle gefallenen Engel in den Himmel zurückbringen. Der gefallene Engel Azazel soll ihm auf dem Weg zu seiner Bestimmung helfen und wurde deswegen nach über 5000 Jahren Gefangenschaft freigelassen. Er erzählt Aaron, dass bei jeder Geburt eines Nephilims die Mutter stirbt und die gefallenen Engel dies auch herausgefunden haben. Dementsprechend ist Aaron wütend auf seinen Vater. Azazel soll ihn zu dem "Lichtbringer" führen. Dabei stellt sich heraus, dass dieser in Wirklichkeit Aarons Vater ist - und sein lateinischer Name lautet Luzifer, der erste gefallene Engel.

An seinem 18. Geburtstag entdeckt Aaron dass er übermenschliche Fähigkeiten besitzt und sogar mit seinem Hund sprechen kann. Ein mysteriöser Obdachloser erzählt ihm, dass er halb Mensch halb Engel sei. Weil eine Gruppe von Engeln die Mischlingsgeschöpfe vernichten will, gerät Aaron in Gefahr.

Als Frau und Sohn des Feuerwehrmanns Gordon Brewer vor seinen Augen bei einem Bombenanschlag auf die kolumbianische Botschaft ums Leben kommen, kennt der Mann nur noch ein Ziel: Rache! Doch Polizei und FBI halten sich bei ihren Ermittlungen aus diplomatischen Gründen zurück. So macht sich Gordon allein nach Südamerika auf, um dem Attentäter Perrini, der sich selbst "Der Wolf" nennt, den Garaus zu machen. Doch die Verstrickungen von Militär, CIA und Terrororganisationen scheinen schier undurchdringbar.