Nach den Ereignissen in dem Themenpark Jurassic World auf der Insel Isla Nublar können die Dinosaurier seit vier Jahren frei leben, bis ein Vulkanausbruch ihre Existenz bedroht. Die frühere Parkmanagerin Claire Dearing hat nun die Dinosaur Protection Group (DPG) gegründet - eine Organisation zum Schutz der Dinosaurier. Sie engagiert Owen Grady, einen ehemaligen Dinosaurier-Trainer, welcher beim Park gearbeitet hatte, um ihr zu helfen, die restlich verbliebenen Dinosaurier von der Insel zu retten. Owen will außerdem Blue ausfindig machen, die letzte Überlebende der vier Raptoren, die er einst trainiert und großgezogen hatte. Außerdem bricht ein neu geschaffener Gen-Hybrid namens Indoraptor aus.

In der Zukunft haben die Menschen das Weltall kolonisiert und streiten sich mit einer feindlichen Alienrasse um den Herrschaftsanspruch. Zuletzt sorgte ein wackeliges Friedensabkommen für Ruhe, doch das scheint hinfällig, seit ein Terroranschlag unzählige Opfer forderte. Um weiteren Attacken vorzubeugen, wird ein Spezialkommando auf einen unwirtlichen Planeten entsandt, wo ihm nur wenige Stunden bleibt, um ein paar Waffenschmuggler unschädlich zu machen. Doch der Planet birgt ein schlimmeres Geheimnis.