Nach der ersten Begegnung Ripleys mit dem Alien sind 57 Jahre vergangen. Ziellos treibt sie sich immernoch im Kälteschlaf befindlich durchs All. Zufällig wird sie entdeckt und wieder zurück zur Erde gebracht. Ihren Berichten über die Ereignisse mit dem Alien wird zunächst wenig Glauben geschenkt, doch als der Kontakt zu dem mittlweile bevölkerten, aus dem ersten Teil bekannten Planeten abbricht, wird Ripley gebeten zusammen mit einem Trupp Space-Marines nach dem Rechten zu sehen. Sie kommen zu spät - die komplette Kolonie wurde von den Aliens überrannt und das Einsatzteam muss es mit der Übermacht aufnehmen...

Der Gangsterboß Xander Drax steht kurz davor, drei Schädel aus Gold, Silber und Jade in seinen Besitz zu bekommen, mit denen der Besitzer, so die Sage, riesige Macht bekommt. Das Phantom, bürgerlicher Name: Kit Walker, will das natürlich verhindern, und nebenbei noch seine Herzensdame Diana befreien, die von Drax entführt wurde.

Emily Shaw und ihr 16-jähriger Sohn Kerry nehmen auf dem Weg nach Texas eine Anhalterin mit. Allerdings ist die vermeintliche Schauspielerin Jayne Ferré in Wahrheit eine Auftragskillerin auf der Flucht vor der Mafia.

Dr. Norman Spencer und seine hübsche Frau Claire sind das, was man ein Traumpaar nennen könnte und seit sie ihr neues Haus bezogen haben, scheint die Ehe nahezu perfekt. Doch die Fassade beginnt gefährlich zu bröckeln, als Claire plötzlich unheimliche Stimmen hört und eine mysteriöse Frauen-Erscheinung zu sehen glaubt. Als sie ihrem Mann davon erzählt, stempelt er ihre Ängste als verrückte Wahnvorstellung ab. Verzweifelt sucht sie nach einer Erklärung für die Vorkommnisse, doch je näher sie der grauenvollen Wahrheit kommt, desto deutlicher wird, dass sich dieser Geist nicht so einfach vertreiben lässt...

Die blinde Musikerin Emma kann nach einer Hornhauttransplantation wieder sehen. Allerdings braucht ihr Gehirn oft mehrere Tage, um die neuen Sinnesreize zu verarbeiten. Als in ihrem Wohnhaus eine Frau ermordet wird, sieht Emma im Flur die Gestalt des Mörders. Doch Detective Hallstrom traut ihrer undeutlichen Wahrnehmung nicht und lehnt sie als Zeugin ab. Mittlerweile wird auch der Mörder auf Emma aufmerksam.