Die Leiche der Teresa Banks wird gefunden, das FBI steht vor einem Rätsel. Ein Beamter verschwindet, und Spezialagent Cooper prophezeit einen weiteren Mord. Derweil befindet sich die hübsche Laura Palmer in dem Kleinstädtchen Twin Peaks auf einem langsamen, aber stetigen Abstieg in die Hölle: Sie nimmt Kokain, schwänzt die Schule, prostituiert sich. Damit hofft sie, ihren Dämonen zu entkommen. Besonders hartnäckig wird Laura von der Alptraumgestalt Bob verfolgt. Als sie von ihm vergewaltigt wird und Laura die Augen aufschlägt, verwandelt sich das personifizierte Böse in ihren Vater.

In einem Geheimlabor in Südafrika arbeitende Wissenschaftler feiern eine Party, die von Nile Spencer, einem ökologisch motivierten Terrorist, und Mitkämpfern überfallen wird. Die Terroristen entwenden dabei tödliche Viren. Die Virologin Dr. Sera Levitt, die als einzige ein Antiserum produzieren kann, wird entführt. Nile droht mit der Tötung der Menschheit. Das US-Militär erwägt die Benutzung der Nuklearwaffen gegen die Terroristen. Der Söldner Marcus Poynt kämpft in einer Kommandomission gegen die Terroristen. Er wird dabei durch eine Bande der Diamantenschmuggler gestört.

Genmanipulierte Ratten verbreiten sich rasend schnell in New York und Umgebung. Die Bestien versetzen die Bevölkerung in Angst und Schrecken. Sie sind stärker und größer als normale Ratten und ernähren sich vorzugsweise von Menschenfleisch. Ihre Klugheit, Anpassungsfähigkeit und ihr Überlebenswille macht sie zu einem unangenehmen Gegner. Susan Costello (Mädchen Amick) und Jack Carver (Vincent Spano) stellen sich der Meute und versuchen sie aufzuhalten...