Nach außen führt Cody Banks das ganz normale Leben eines ganz normalen Jugendlichen. Mathe bestehen und Mädels aufreißen, das sind seine größten Herausforderungen. Was aber nicht einmal seine Eltern ahnen: Cody wurde in einem Feriencamp vom Geheimdienst CIA als Nachwuchs-Agent rekrutiert und hat sich als echtes Spionage-Talent erwiesen. Jetzt erhält er seinen ersten Auftrag: Er soll sich an seine Mitschülerin Natalie Connors heranmachen. Denn Natalies Vater, ein zerstreutes Genie, spielt dem irren Ober-schurken Brinkman ungewollt eine Erfindung in die Hände, mit der sich die Erde vernichten lässt...

In einem Geheimlabor in Südafrika arbeitende Wissenschaftler feiern eine Party, die von Nile Spencer, einem ökologisch motivierten Terrorist, und Mitkämpfern überfallen wird. Die Terroristen entwenden dabei tödliche Viren. Die Virologin Dr. Sera Levitt, die als einzige ein Antiserum produzieren kann, wird entführt. Nile droht mit der Tötung der Menschheit. Das US-Militär erwägt die Benutzung der Nuklearwaffen gegen die Terroristen. Der Söldner Marcus Poynt kämpft in einer Kommandomission gegen die Terroristen. Er wird dabei durch eine Bande der Diamantenschmuggler gestört.

Die Überreste von Imhotep und Anck-su-Numam werden nach London in ein Museum gebracht. Dort verweilen sie auch für zehn Jahre, und in der Zwischenzeit ziehen Rick und Evelyn ihren kleinen Jungen auf. Doch dann erwacht Anck-su-Numam aus ihrer Ruhe, denn sie ist hinter dem Kleinen her. Er soll der Schlüssel für die Wiedergeburt der ägyptischen Göttin Isis sein