In den letzten Szenen von "Sharknado 5: Global Swarming" ist Fin der einzige Überlebende, nachdem die Erde durch die Sharknados zerstört wurde. Nun muss Fin in Sharknado 6 durch die Zeit reisen, um den Sharknado zu verhindern, mit dem alles begann. Werden Fin und sein Team es schaffen, die Ordnung wiederherzustellen und die Welt ein weiteres Mal zu retten?

Nachdem ein tiefschwarzer Asteroid, der sämtliches Sonnenlicht absorbiert hatte und so für alle NASA-Frühwarnsysteme unsichtbar geblieben ist, auf der Erde eingeschlagen ist, kämpft im Nordwesten der USA eine fünfköpfige, junge Familie um die nackte Existenz! Der massive Einschlag hat zahlreiche, sich selbst potenzierenden Naturkatastrophen ausgelöst. Überall auf der Welt brechen Vulkane aus, die Druckwelle des Einschlags hat gigantische Wirbelstürme entstehen lassen und vom Einschlagort im Pazifik aus bewegt sich ein mehrerer 100 Meter hoher Tsunami auf die Westküste Nordamerikas zu! Es scheint keinen Ort mehr zu geben, an dem ein Überleben möglich wäre...