Die Fotojournalistin Jennifer Preston ist nach einer Explosion in der Silvesternacht in einer nicht namentlich benannten englischen Metropole auf der Suche nach dem Auslöser für die verstörenden Ereignisse, die sie seit der Katastrophe beobachtet. Durch Ihre Nachforschungen stößt sie auf ein Netz aus Lügen, die dazu dienen, ein paranormales Phänomen zu verschleiern, das schon lange in den Gewölben der Stadt schlummert und von der Regierung unter allen Umständen geheim gehalten wird.

Nach einer missglückten Mission wird Geheimagent Ethan Hunt mehr denn je mit den Konsequenzen seiner vergangenen Taten konfrontiert. Während ihn seine Vergangenheit heimsucht, sieht sich die Welt einer schweren nuklearen Bedrohung ausgesetzt. Unter der Führung des neuen IMF-Chefs Alan Hunley müssen Ethan, seine Kollegen Benji Dunn und Luther Stickell sowie MI6-Agentin Ilsa Faust in einem Wettlauf gegen die Zeit einmal mehr eine Katastrophe verhindern...